机械电子工程系建有机械电子工程和机器人工程两个本科专业。机械电子工程专业始于1994年，是教育部“卓越工程师教育培养计划”专业，入选浙江省一流本科专业建设点。机器人工程专业为新工科专业。机械电子工程系已在智能纺织装备和机器人技术等方向形成鲜明科学研究和人才培养特色。

依托的“机械工程”学科拥有一级学科博士点、博士后科研流动站，入选浙江省重点建设高校优势特色学科和A类一流学科。拥有机械基础国家级实验教学示范中心、纺织装备国家级虚拟仿真实验教学中心、浙江省2011高端装备设计制造协同创新中心、智能纺织装备省级工程实验室、浙江省现代纺织装备技术研究重点实验室等重要平台。

现有教师33人，其中教授8人，包括国家杰出青年科学基金获得者1人、国家“万人计划”科技创新领军人才1人、全国优秀教师1人、全国五一劳动奖章获得者1人，享受国务院特殊津贴教师2人。本系拥有本-硕-博人才培养能力，每年硕士生110人、本科生150人。

近5年来共承担国家级项目15项（其中国家级重大项目2项、国家级重点项目4项）、省部级科研项目29项（其中浙江省重点研发计划项目5项），累计到账科研经费6399万元。发表论文322篇（其中SCI收录111篇），授权发明专利140件，获国家科技进步二等奖1项、获省部级科研奖励4项。承担省级一流课程1门，获得省级教学成果奖3项，在学科竞赛中培养学生获国家一等奖9项、二等奖11项，省级奖励超100项。